مهارت وی در ریاضی و معماری و مهندسی معروف بوده
و از مهمترین خدمات شیخبهایی در رونق بخشیدن به شهر اصفهان تعیین سمت قبله مسجد شاه
(امام) اصفهان است. این قبلهیابی که با استفاده از ابزارهای آن زمان صورت پذیرفته
هفت درجه با جهت واقعی قبله اختلاف دارد . تقسیم آب زاینده رود به محلات اصفهان و روستاهای
مجاور رودخانه، ساخت گلخن گرمابهای است که هنوز در اصفهان مانده معروف به حمام شیخ
بهائی و طراحی منار جنبان اصفهان که هم اکنون نیز پا برجاست به او نسبت داده میشود. همچنین
طرح ریزی کاریز نجف آباد-اصفهان است که به نام قنات زرین کمر، (یکی از بزرگترین کاریزهای
ایران) و معماری مسجد امام اصفهان و مهندسی حصار نجف و شاخص تعیین اوقات شرعی (ساعت
آفتابی در مغرب مسجد امام) را به او نسبت می دهند. روایتی شیخ بهایی را احتمالا مبدع تهیه نان سنگک،و
حلوا شکری نیز می دانند .
خدمات علمی جابربن حیان
کشف مواد شیمیایی متعددی همچون هیدرو کلریک اسید،
نیتریک اسید، تیزاب (مخلوطی از دو اسید یاد شده که از جمله اندک موادی است که طلا را
در خود حل میکند)، سیتریک اسید (جوهر لیمو) و استیک اسید (جوهر سرکه)، همچنین معرفی
فرایندهای تبلور و تقطیر که هر دو سنگ بنای شیمی امروزی به شمار میآیند، از جمله یافتههای
اوست. او همچنین یافتههای دیگری دربارهٔ روشهای استخراج و خالص سازی طلا، جلوگیری
از زنگ زدن آهن، حکاکی روی طلا، رنگرزی و نم ناپذیر کردن پارچهها و تجزیهٔ مواد شیمیایی
ارائه داد. از جمله اختراعهای دیگر او، قلم نوری است. قلمی که جوهر آن در تاریکی نیز
نور میدهد. (احتمالاً با استفاده از خاصیت فسفرسانس این اختراع را انجام دادهاست.)
در آخر، بذر دسته بندی امروزی عنصرها به فلز و نافلز را میتوان در دست نوشتههای وی
یافت.